So wie torment es sagt ist es. Du hast 3 Monate Zeit zur Einreise. die 60 Tage beginnen aber erst mit der Einreise.
Außerdem kannst du das Visum problemlos vor Ort auf bis zu 6 Monate verlängern. wenn du denn wirklich 61 Tage in Indonesien bleiben würdest, würd ich es aber so wie dowe sagt machen. Gängige Praxis, und die Beamten die deinen Ausreisestempel dann auch schon mal gerne zurückdatieren, müssen ja auch ein bisschen verdienen